医院设有呼吸内科、脂肪肝门诊、血液内科、肿瘤内科、神经内科、肾内科、消化内科、心血管内科、风湿免疫科、内分泌科、康复医学科、血吸虫病门诊、全科专家、急诊科、神经外科、肝胆外科、骨科、心胸外科、肛肠外科、泌尿外科、乳腺科、血管外科、普外科、整形外科、疼痛科、普通外科、小儿外科、麻醉科、胃肠外科、头颈外科、普通外科、烧伤整形科、妇科、皮肤科、临床心理科、耳鼻咽喉科、眼科、口腔科、中医科、检验科、病理科、超声科、放射科、核医学科、高压氧科、输血科、特检科、心电科、营养科、药学部等临床科室和医技科室。
一、浙江省医学重点扶持学科：血吸虫病科。
二、浙江省、嘉兴市共建医学重点扶植建设学科：消化科、病理科。
三、浙江省省中西医结合重点建设学科：疼痛科。
四、嘉兴市支撑学科：呼吸病学、胃肠病学、血液病学、感染性疾病学、麻醉学、重症医学、病理学、针灸学。
五、嘉兴市扶持学科：心血管病学、普通外科学、急诊医学、神经病学、肿瘤学、放射诊断学、胸外科学、泌尿外科学、骨外科学。
一、优势病种：血吸虫病、急诊消化道出血、食道静脉曲张、脑出血、脑梗死、蛛网膜下腔出血、短暂性脑缺血发作、脑动脉硬化、脑动脉供血不足、痴呆、癫痫、肺部感染、慢阻肺、呼吸衰竭、睡眠障碍、哮喘、胸膜疾病、晚期肺癌、晚期食管癌、晚期乳腺癌、骨与关节疾病、运动系统/神经系统病损、疼痛疾病、骨质疏松症、骨关节炎、强直性脊柱炎、类风湿性关节炎、肩周炎、周围血管病、小儿脑瘫、神经炎、周围神经损伤、面神经麻痹、盆腔炎、肋软骨炎、慢性溃疡。
二、优势技术：气管镜下的单向活瓣的封堵治疗难治性气胸、超声气管镜下淋巴结穿刺活检、气管镜下的支架植入、睡眠呼吸暂停监测、CPAP治疗、局限期小细胞肺癌的同步放化疗、食管癌的新辅助放化疗、晚期非小细胞肺癌化疗、乳腺癌根治术、乳癌术后的辅助化疗、内分泌及分子靶向药物治疗、直肠癌术前同步放化疗、急性脑梗死的动脉溶栓治疗、急性缺血性卒中超早期的静脉溶栓、脑出血微创血肿清除术、肉毒素注射治疗面肌痉挛、血尿轻链测定、骨髓造血细胞培养、染色体检查、融合基因检测及肿瘤细胞培养药敏试验。
